Das Wappen von Neukirchen enthält die traditionellen friesischen Farben Gold, Rot und Blau.

Die goldenen Sterne und die Mondsichel sind ein Zitat aus dem Wappen der Wiedingharde, der die Gemeinde angehört. Der goldene Balken symbolisiert den „Goldenen Ring“, der als Deich des Wiedingharder Alten Kooges das Gemeindegebiet teilt. Das stilisierte Boot erinnert an die sogenannten „Hemsenboote“, die lange Zeit das Hauptverkehrsmittel im Gotteskoog waren.